Smoothed landmark estimators of the transition probabilities

One important goal in clinical applications of multi-state models is the estimation of transition probabilities. Recently, landmark estimators were proposed to estimate these quantities, and their superiority with respect to the competing estimators has been proved in situations in which the Markov condition is violated. As a weakness, it provides large standard errors in estimation in some circumstances. In this article, we propose two approaches that can be used to reduce the variability of the proposed estimator. Simulations show that the proposed estimators may be much more efficient than the unsmoothed estimator. A real data illustration is included

Meio século de investigação sociológica em Portugal : uma interpretação empiricamente ilustrada

Born in 1962 with the creation, by Adérito Sedas Nunes, of the Gabinete de Investigações Sociais (today, Instituto de Ciências Sociais da Universidade de Lisboa), Portuguese sociology is almost 50 years old. In this text, these almost 50 years of sociological research in Portugal are taken as an object of sociological research and empirically interpreted. The text is divided in three parts. The ?rst, without repeating the reconstitutions of the historic trajectory of the discipline made by others, brings new information and underlines fundamental aspects of the advanced institutionalisation of sociology in Portugal. In the second, the domains of research that have been explored by Portuguese sociologists are identi?ed in detail, voids and declines are pointed out and the questions of the divisions that emerged in some of those domains with other social sciences are analysed. In the third part the dominant generators of sociological research are described and compared: the socio-cultural generator and the political-social generator. We end by presenting an inventory of some controversies over the trajectory, the situation and the capacities of Portuguese sociolog

p3state.msm: Analyzing Survival Data from an Illness-Death Model

In longitudinal studies of disease, patients can experience several events across a followup period. Analysis of such studies can be successfully performed by multi-state models. In the multi-state framework, issues of interest include the study of the relationship between covariates and disease evolution, estimation of transition probabilities, and survival rates. This paper introduces p3state.msm, a software application for R which performs inference in an illness-death model. It describes the capabilities of the program for estimating semi-parametric regression models and for implementing nonparametric estimators for several quantities. The main feature of the package is its ability for obtaining nonMarkov estimates for the transition probabilities. Moreover, the methods can also be used in progressive three-state models. In such a model, estimators for other quantities, such as the bivariate distribution function (for sequentially ordered events), are also given. The software is illustrated using data from the Stanford Heart Transplant Study.

Presmoothed Landmark estimators of the transition probabilities

Multi-state models can be successfully used to model complicated event history data, for example, describing stages in the disease progression of a patient. In these models one important goal is the estimation of the transition probabilities since they allow for long term prediction of the process. There have been several recent contributions for the estimation of the transition probabilities. Recently, de Uña- Álvarez and Meira-Machado (2015) proposed new estimators for these quantities, and their superiority with respect to the competing estimators has been proved in situations in which the Markov condition is violated. In this paper, we propose a modification of the estimator proposed by de Uña-Álvarez and Meira-Machado based on presmoothing. Simulations show that the presmoothed estimators may be much more efficient than the completely nonparametric estimator.This project was funded by FEDER Funds through “Programa Operacional Factores de Competitividade - COMPETE” and by Portuguese Funds through FCT - “Fundação para a Ciência e a Tecnologia”, in the form of grant PEst-OE/MAT/UI0013/2014.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Pilot-model for oxidative post-competition recovery in swimmers

Physical exercise have several health benefits, but it can also be a source of cellular damage. The energetic demands of physical exercise and training promote an increase on metabolic rate, and its pathways may produce secondary harmful compounds that will cause cellular damage. Some of those compounds are the free radicals and Reactive Oxygen species, which are highly instable molecules that react quickly, oxidizing important functional molecules such as proteins, membrane lipids and DNA, in a condition known as oxidative stress. To dampen the action of these molecules, the cells express antioxidant defence proteins. One of the most ubiquitous and polymorphic of those is the family of Gluthatione STransferases (GSTs). The great physical load of competitive training creates serious oxidative stress on athletes so, it is expected that their expression of GSTs will vary throughout the season to overcome such aggression, quickly recovering from one training session and preparing the antioxidant defence for the next one. Our main objective was to verify if the expression of a GST (GSTT1) varies throughout the season, as expected theoretically, and how it fluctuates after a competition. We also check if the distribution of the GSTM1 and GSTT1 Null/Present genotypes had some influence in the preparation and performance of our sample, consisting in 20 national level swimmers. A control group of 52 random individuals was also used to compare genotype distribution. We collected blood samples in analytic filter paper, at 5 different moments throughout the winter season. DNA was isolated from a sample of each individual, amplified by PCR for our interest genes, and ran in agarose gel by electrophoresis to genotype our 20 swimmers. RNA was isolated from all the samples of a swimmer and converted in cDNA by reverse transcriptase. The relative expression of GSTT1 was done using β-actin (a housekeeping gene) as a control gene and the first collected sample of the swimmer as control condition, by the RT-PCR technic. Three swimmers were accessed for the whole 5 moments, while eight were only evaluated their expression at 48h and 72h after competition. The results showed little influence in the distribution of genotype from swimmers to controls. The expression results show influence of the GSTT1 expression profile throughout the season and after an intense exercise with sport performance and as a fitness check tool.O treino desportivo com o objetivo de performance competitiva coloca os atletas sob um forte risco de desequilíbrio oxidativo, conhecido por stress oxidativo. A produção de radicais livres e espécies electrofílicas, como as Espécies Reativas de Oxigénio (ROS), são uma constante no metabolismo normal do organismo, no entanto, a maior taxa metabólica exigida pela demanda energética do exercício físico intenso, provocam uma produção de tais espécies a um nível superior às defesas antioxidantes disponíveis. Nesta situação de stress oxidativo, os radicais livres e ROS provocam danos a fulcrais estruturas e macromoléculas celulares, reagindo forte e rapidamente com estas, ameaçando a homeostasia celular. Para controlar a ação nefasta dessas agressões oxidativas, os organismos possuem mecanismos de defesas antioxidantes, podendo estas ser de origem endógena ou exógena. Entre as defesas antioxidantes endógenas encontram-se proteínas expressas pelas células, e cuja expressão pode ser influenciada pelo ambiente oxidativo celular, como é o caso das Glutationa S-Transferases (GST). Desta forma, situações que criem stress oxidativo, como no treino desportivo, ativam a expressão das defesas antioxidantes. Assim sendo, o treino desportivo regular e bem planeado, de forma a evitar danos constantes ao organismo, deve ativar uma resposta deste de forma a protege-lo dessa agressão, preparando-o previamente para essa agressão. Essa preparação pode ser verificada através da expressão génica de fatores antioxidantes endógenos. Além disso, certos genótipos podem revelar-se vantajosos nesta proteção, nomeadamente os genótipos associados às várias isoformas das GSTs. Nestes, constam vários e frequentes genótipos Null (ausência do gene), o que permite uma grande variabilidade entre indivíduos para a disponibilidade de isoformas de GSTs. O objetivo deste trabalho foi precisamente verificar a distribuição de genótipos Null/Present para duas isoformas de GSTs, a GSTM1 e a GSTT1, numa amostra de 20 nadadores portugueses de nível nacional. Para comparação de genótipos, foi recolhida semelhante informação a partir de um grupo de controlo constituído por 52 indivíduos aleatórios. Além disso, observou-se a expressão relativa de GSTT1 ao longo de 5 momentos distintos ao longo da época de Inverno (preparação geral, preparação específica, fase taper e dois momentos pós-competição) em 3 desses atletas, e a expressão relativa, também de GSTT1, 48h e 72h após uma competição, para 8 desses atletas. Para conseguir alcançar isto, foi necessário montar uma técnica totalmente nova para recolher as amostras de forma rápida, fiável e praticável nas condições de treino, e otimizar todos os procedimentos laboratoriais para conseguir processar essas amostras de forma eficiente e rigorosa. As amostras foram recolhidas em papel de filtro de análises clínica, através de uma picada no dedo dos nadadores, antes do início do treino do dia definido previamente para recolha de amostras. As amostras foram ainda conservadas em invólucros individuais para cada recolha a cada momento e de cada atleta, numa câmara-fria 4°C, no Centro de Investigação em Ciências da Saúde (CICS) da Faculdade de Ciências da Saúde (FCS) da Universidade da Beira Interior (UBI). Para genotipagem dos nadadores em amostra, DNA foi extraído da amostra de sangue em papel utilizando o método do Chelex 100. Após extração, o DNA foi usado para amplificação enzimática da sequência específica dos genes da GSTM1 e GSTT1, pela técnica de PCR. Por fim, os resultados foram corridos por electroforese em gel de agarose, usando Green-safe como fator de marcação de DNA, e os resultados foram visualizados à luz ultravioleta num transiluminador. A presença de GSTM1 foi identificada pela presença de uma banda com cerca de 215bp, enquanto a presença de GSTT1 foi identificada pela presença de banda aos 473bp. Para análise da expressão génica, RNA foi isolado a partir das amostras de sangue em papel, pelo método do Trizol. O RNA era correspondente a cada um dos momentos de recolha. De seguida o RNA foi convertido a cDNA através da técnica de transcriptase reversa, utilizando a enzima M-MLV. Por fim, o cDNA foi amplificado pela técnica de RT-PCR, para o gene GSTT1, tendo ainda como controlo a amplificação da β-Actin, também para cada um dos momentos de recolha e fazendo duplicados por uma questão de rigor. A expressão foi calculada através das curvas de amplificação de RT-PCR e utilizando o método ΔΔCT. Não foram encontradas distribuições de genótipos GSTM1 e GSTT1 Null/Present estatisticamente significativas entre a nossa amostra de teste e o grupo de controlo. No contexto da expressão relativa de GSTT1, verificou-se que variações muito acentuadas ao longo da época desportiva ou após um exercício foram prejudiciais à performance física dos nadadores. Encontramos também algumas diferenças na recuperação das nadadoras, mantendo uma expressão mais alta e por um maior período de tempo após o exercício físico intenso que os homens. Além disso, verificou-se uma tendência para os indivíduos GSTM1 Null manterem os níveis de expressão relativa de GSTT1, ao longo da época e após um exercício intenso, mais estáveis, o que parece favorecer o seu rendimento. Conclui-se ainda que a análise da evolução da expressão relativa de GSTT1 em vários treinos, após uma competição ou outro exercício de elevada intensidade, pode ajudar a perceber qual a forma atual de um nadador

The application of a customer relationship system (CRM) in Banco Espírito Santo (BES) : case study

Síntese: Hoje, o mercado financeiro apresenta imensos desafios, desde as novas tecnologia, falta de capital e mudança de como os consumidores percepcionam os seus bancos. Um destes desafios é a mudança da relação dos bancos com os seus consumidores, que cada vez se deslocam menos aos balcões. O Banco necessita de ter outra maneira de comunicar com os seus clientes. A relação banco-cliente é essencial para reter e atrair novos clientes. É nesta oportunidade que entra o sistema de CRM ( gestão de relacionamento com o cliente). O CRM é percepcionado como um software que lida com toda a informação do cliente, que disponibiliza ao Banco como contactar e porque contactar o cliente e quando. Existem muitas variáveis que são importantes para este relacionamento e para poder ser bem sucedido que são abordadas neste caso. O Banco Espírito Santo é um dos maiores bancos portugueses e tem como objectivo principal a satisfação e o serviço entregue aos clientes. Para atingir este objectivo o Banco focou-se neste serviço de qualidade superior e de integridade. Neste caso veremos como o BES se relaciona com os seus clientes, como usa esta relação em seu benefício e como é que o sistema de CRM o ajudou para melhorar esta relação e os seus resultados. Veremos uma grande quantidade de exemplos práticos do dia-a-dia do banco, bem como tudo o que se passa nos bastidores, com uma visão desde a administração, equipas de marketing e balcões e como todos lidam com este novo sistema de CRM.Summary: Today, the financial market faces huge challenges: new usage of technology, scarcity of capital and changes in how consumers perceive and interact with their banks. A new dynamic is evolving in the bank-consumer relationship. Clients, who are borrowing and spending less but saving more, do not frequent the bank in person as they once did. Banks must resort to other ways of communicating with their clients. A strong bank-customer relationship is essential for retaining and attracting new customers. Customer Relationship Management systems and software create opportunities to improve customer satisfaction. Microsoft and Oracle produce CRM software that handles client data and helps users interact with all clients. Customer Management has many variables that are important in improving this relationship and client perception. Banco Espírito Santo is one of the largest Portuguese banks and has as its main marketing goals customer satisfaction and the quality of service. To achieve these goals the bank has focused on top quality service and integrity. In this case study we will see how BES relates to its customers, how this relationship is used to an advantage and how the CRM system has helped to improve this relationship and business results. We'll see a selection of practical examples in day-to-day banking practices as well as what goes on behind the scenes from administrative, marketing and structural perspectives

Estimation of multivariate distributions for recurrent event data

In many longitudinal studies information is collected on the times of different kinds of events. Some of these studies involve repeated events, where a subject or sample unit may experience a well-defined event several times along his history. Such events are called recurrent events. In this work we consider the estimation of the marginal and joint distribution functions of two gap times under univariate random right censoring. We also consider the estimation of the bivariate survival function.This research was financed by Portuguese Funds through FCT - “Funda¸c˜ao para a Ciˆencia e a Tecnologia”, within Project UID/MAT/00013/2013.info:eu-repo/semantics/publishedVersio